短短的十幾年時間，微波輻射技術在環境工程領域中已經取得了令人鼓舞的成績，其應用前景也被廣泛看好。但是，由于環境研究屬新興的多學科交叉性綜合領域，相關的理論基礎比較復雜，所用的研究方法尚不統一，要深入理解和掌握這些技術具有一定的難度，在應用過程中不可避免地存在著一些問題，使該技術的應用受到一定的限制。

    1微波誘導氧化的作用機理研究

    環境微波處理的理論基礎目前多被認為是微波誘導氧化作用機理，一般描述為：將高強度短脈沖微波聚焦到某些含有“敏化劑”（如鐵磁金屬）的固體催化劑床表面上，由于金屬表面的金屬點位與微波輻射能的強烈相互作用，微波輻射能被轉變為熱能，從而使某些表面點位選擇性地被很快加熱至很高溫度。盡管反應器中的任何試劑都不會被微波直接加熱，但當它們與受激發的表面點位接觸時卻可發生反應。問題是這些“熱點”是如何產生的，它們與傳統加熱法產生的“熱點”有什么不同。微波參與的過程目前多被理解為是一種熱過程，而在實際應用中，有些過程不僅僅是熱能解決的。那么，這些過程中究竟有沒有某種非熱效應存在，迄今為止，有關非熱效應存在的論據都因微波場中的溫度測量的不確定性而受到質疑。

    2微波場中溫度的測量

    微波輻射技術在環境工程中的很多應用都是基于其熱效應，因此，測量或者計算微波場中的溫度顯得特別重要。有很多人試圖建立各種數學模型來計算微波場中的溫度，但由于微波場中的溫度尚無大家認可的方法進行精確測量，這些模型均無法加以驗證。微波加熱與物質的介電性質有著密切的聯系，物質的介電性質又與其形狀、組成、體積和濕度等多種因素有關，這些因素都有可能較大程度地影響著微波場中的溫度分布，因此微波場中溫度的測量方面研究是一項亟待解決工作。

    3微波設備的安全防護

    隨著微波輻射技術的開發和廣泛應用，微波輻射的空間強度和接觸微波輻射的人數逐漸增加，微波輻射對人體健康的影響已為人們所關注。研究表明，如果微波輻射量控制適當，可對人體產生良好的刺激作用，在醫療上可作為治療疾病的一種手段。但是，過量的微波輻射對人的神經系統、心血管系統、生殖系統、晶狀體和視網膜等器官有一定的損害。因此，在設計、制造和使用微波設備時，應注意微波泄漏的安全防護，以保證操作人員的人身安全。